Perattu muikku sopii monipuolisesti ruoanlaittoon. Voissa paistetut muikut ovat monelle ehdoton suosikkiruoka, mutta myös savustetut muikut vievät kielen mennessään. Muikku on erittäin hyvää myös keitossa ja piirakassa tai pikkusuolaisena vaikkapa napostelulautasella.